本文介绍了在 python 中读取 *.mhd/*.raw 格式的处理方法，对大家解决问题具有一定的参考价值，需要的朋友们下面随着跟版网的小编来一起学习吧！
问题描述
谁能告诉我如何在 python 中读取包含 .mhd/.raw 文件的数据集?
Can anyone please tell me the way I can read a dataset containing .mhd/.raw files in python?
推荐答案
最简单的方法是使用 SimpleITK (MedPy 也将 ITK 用于 .mhd/.raw 文件).命令
The easiest way is to use SimpleITK (MedPy uses ITK for .mhd/.raw files too). Command
pip install SimpleITK
适用于许多 python 版本.要阅读 .mhd/.raw，您可以使用此代码 来自 kaggle
works for many python versions. For reading .mhd/.raw you can use this code from kaggle
import SimpleITK as sitk
import numpy as np
'''
This funciton reads a '.mhd' file using SimpleITK and return the image array, origin and spacing of the image.
'''
def load_itk(filename):
# Reads the image using SimpleITK
itkimage = sitk.ReadImage(filename)
# Convert the image to a numpy array first and then shuffle the dimensions to get axis in the order z,y,x
ct_scan = sitk.GetArrayFromImage(itkimage)
# Read the origin of the ct_scan, will be used to convert the coordinates from world to voxel and vice versa.
origin = np.array(list(reversed(itkimage.GetOrigin())))
# Read the spacing along each dimension
spacing = np.array(list(reversed(itkimage.GetSpacing())))
return ct_scan, origin, spacing
这篇关于在 python 中读取 *.mhd/*.raw 格式的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持跟版网！
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