其实dedecms官方网站也给出了一些安全设置的参考，其实下面的文章都是根据这个而来，再继续往下看：
首先：服务器安全设置之 IIS用户设置方法，其实各个网站独立用户才比较安全
网站安全中，对目录的执行权限是非常敏感的，一般来说，可以写入的目录是不能够拥有脚本的执行权限的，像DedeCMS系统，可写入的有两个目录data、uploads，data目录主要是基本配置文件和缓存数据，uploads则是附件上传保存的目录，本篇将针对不同服务器环境来介绍如何取消这两个目录的执行权限，当然我们也建议用户其他一些生成纯静态html的目录，拥有可写入权限的也统统去除执行权限，这样系统会更为安全。
Windows下的IIS IIS6.0
打开IIS中站点，在站点uploads目录、data目录以及静态html生成目录点击右键，菜单中选择“属性”，在目录属性面板选择执行权限为“无”即可。（如图1）
IIS7
IIS7也类似于IIS6.0，选择站点对应的目录，data、uploads及静态html文件目录，双击功能试图面板中的“处理程序映射”（如图2）
在“编辑功能权限……”中，我们直接去除脚本的执行权限即可。（如图3）
其实上面只是介绍了如果取消执行权限，根据官方的推荐还需要设置目录写权限的设置方法，这里跟版网模板简单的介绍下
例如a目录，一般是生成静态页面用的，那么我们就需要服务器端设置(dederun是iis中运行网站匿名用户)
Apache下目录脚本的执行权限设置 独立主机配置
在Apache中，没有Windows 下IIS的图形管理界面，我们需要手工修改下apache的配置文件，来进行目录脚本的执行权限的设定。
首先我们找到apache的配置文件httpd.conf，通常情况下，该配置文件在apache安装目录下的conf文件夹中（如图4）。
（图4）
打开httpd.conf文件，找到内容中如图5的位置：
（图5）
将需要限制执行脚本文件的目录配置添加到下方：
配置内容为：
<Directory "DIR">
<FilesMatch ".(php|asp|jsp)$">
Deny from all
</FilesMatch>
</Directory>
配置内容中的DIR为需要限制执行脚本文件的目录，FilesMatch后的内容为需要限定的执行的脚本后缀名。例如：这里需要禁止测试站点uploads文件夹下的PHP，ASP，JSP脚本的运行，则进行如下图6配置：
（图6）
在配置完成后，重启一下apache，配置便生效！
在操作前，uploads文件夹下我新建了一个index.php文件，图7为未作配置前访问情况
（图7）
图8为重启apache后访问该页面的效果。
（图8）
虚拟主机/空间配置
在配置前需要确认你的空间是否支持.htaccess和rewrite，该方法基于.htaccess文件中使用rewrite来达到禁止指定脚本的运行效果。
规则内容如下：
RewriteEngine on RewriteCond % !^$
RewriteRule uploads/(.*).(php)$ – [F]
RewriteRule data/(.*).(php)$ – [F]
RewriteRule templets/(.*).(php)$ – [F]
针对uploads，data，templets 三个目录做了执行php脚本限制；
将如上内容存储至到.hatccess文件中，将该文件存放到你的站点根目录下，
这样，目录脚本的执行权限就控制好了，规则上传前后的效果同图7，图8。
nginx环境规则内容如下：nginx执行php脚本限制
LNMP有一个缺点就是目录权限设置上不如Apache，有时候网站程序存在上传漏洞或类似pathinfo的漏洞从而导致被上传了php木马，而给网站和服务器带来比较大危险。建议将网站目录的PHP权限去掉，当访问上传目录下的php文件时就会返回403错误。
首先要编辑nginx的虚拟主机配置，在fastcgi的location语句的前面按下面的内容添加：
代码如下:
location ~ /(data|uploads|templets)/.*\.(php|php5)?$ {
deny all;
}
好了就这些吧，做了这些应该不会有什么问题基本够用！建议用dedecms的朋友花点时间去设置一下.
这里也推荐一篇视频教程，说的与设置都比较详细 DedeCMS目录安全设置教程For IIS 在线播放